Після запуску матеріал поміщається в резервуар для заморожування. Процес заморожування включає два аспекти: по-перше, вакуумна система видаляє деяку кількість вологи шляхом створення вакууму; по-друге, коли матеріал замерзає, деякі молекули води витісняються на поверхню й замерзають. Коли вимога до заморожування виконана, система опалення нагріває та сушить матеріал, створюючи вакуум для видалення будь-якої залишкової вологи, яка потім переноситься до морозильної пастки для заморожування, таким чином досягаючи вимоги до-сушіння заморожуванням.
Ліофілізаційне-сушіння означає процес видалення води чи інших розчинників із заморожених біологічних продуктів шляхом сублімації. Сублімація означає процес, коли розчинник, наприклад вода, як сухий лід, безпосередньо переходить із твердого стану в газоподібний, не проходячи через рідкий стан. Продукт, отриманий шляхом-ліофілізаційного сушіння, називається ліофілізатором, а процес — сублімаційним-сушінням. Традиційне сушіння викликає усадку матеріалу і пошкоджує клітини. Під час-сушіння заморожуванням структура зразка не руйнується, оскільки тверді компоненти підтримуються льодом на своєму місці. Коли лід сублімується, він залишає пори у висушеному залишку. Це зберігає цілісність біологічної та хімічної структури продукту та його активність. У лабораторії сублімаційне{11}}сушіння має багато різних застосувань і є незамінним у багатьох біохімічних і фармацевтичних застосуваннях. Він використовується для отримання біологічних матеріалів, які можна зберігати протягом тривалого часу, наприклад мікробних культур, ферментів, крові та фармацевтичних препаратів, зберігаючи не лише свою довгострокову стабільність, але й притаманну їм біологічну активність і структуру. З цієї причини ліофілізація використовується для підготовки зразків тканин для структурних досліджень (таких як електронна мікроскопія). Ліофілізація також застосовується в хімічному аналізі, забезпечуючи висушені зразки або концентруючи зразки для підвищення аналітичної чутливості. Ліофілізація стабілізує компоненти зразка, не змінюючи їх хімічний склад, що робить її ідеальною аналітичною допомогою. Ліофілізація може відбуватися природним шляхом. У природних умовах цей процес повільний і непередбачуваний. Завдяки розробці систем ліофілізації було вдосконалено та вдосконалено багато етапів, що прискорило цей процес.
